農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)設(shè)計的核心依據(jù)可分為法律法規(guī)政策、規(guī)劃標(biāo)準(zhǔn)、項目基礎(chǔ)條件、可持續(xù)與生態(tài)要求四大類，具體如下：

1. 國家級法律法規(guī)與核心政策文件
   以《中華人民共和國預(yù)算法》為上位法依據(jù)，嚴(yán)格遵循《國家農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)資金和項目管理辦法》（2016修訂版、2025沿用版）的要求，同時落實《國務(wù)院辦公廳轉(zhuǎn)發(fā)財政部關(guān)于加強農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)工作若干意見的通知》《農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)區(qū)域生態(tài)循環(huán)農(nóng)業(yè)項目指引(2017-2020年)》等專項政策中關(guān)于建設(shè)任務(wù)、投入機制、扶持范圍的規(guī)定。
2. 規(guī)劃與行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)體系
• 頂層規(guī)劃：需符合農(nóng)業(yè)發(fā)展中長期規(guī)劃、國家農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)政策、區(qū)域水資源利用總體規(guī)劃、節(jié)水灌溉發(fā)展規(guī)劃、糧食生產(chǎn)核心區(qū)建設(shè)規(guī)劃、土地利用整體規(guī)劃等。
• 行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)：執(zhí)行《國家農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)土地治理項目建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)》等專項標(biāo)準(zhǔn)，例如平原地區(qū)格田規(guī)模、農(nóng)田防護林網(wǎng)控制率、人工造林成活率等均有明確量化要求。
3. 項目前期基礎(chǔ)材料與要求
• 項目儲備：需從符合要求的項目庫中擇優(yōu)選擇，項目庫入庫需達到項目建議書標(biāo)準(zhǔn)，且經(jīng)過2/3以上農(nóng)戶簽字同意或村民代表大會通過。
• 可行性要求：基于具備相應(yīng)資質(zhì)單位編制的可行性研究報告，覆蓋水土資源評價、技術(shù)可行性、經(jīng)濟合理性、籌資方案、效益預(yù)測等核心內(nèi)容，且通過農(nóng)發(fā)機構(gòu)組織的專家評審。
4. 可持續(xù)發(fā)展與生態(tài)紅線要求
   遵循農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)“三類區(qū)域”開發(fā)管控要求：資源環(huán)境承載力強的區(qū)域重點開發(fā)，承載力有限區(qū)域保護性開發(fā)，生態(tài)脆弱區(qū)域限制開發(fā)；同時項目需符合生態(tài)環(huán)境保護和資源節(jié)約利用要求，生態(tài)循環(huán)類項目要求秸稈/糞便等循環(huán)利用率≥90%。
5. 地方配套規(guī)定
   需符合省級農(nóng)發(fā)機構(gòu)制定的本地區(qū)農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)具體政策、發(fā)展規(guī)劃，以及地方出臺的相關(guān)條例（如已廢止的《河南省農(nóng)業(yè)綜合開發(fā)條例》）中關(guān)于項目管理、開發(fā)原則的要求。